蔡宝昌教授共主持研究课题39项，其中国家级课题23项。
表1 蔡宝昌教授主持的代表性科研课题
课题名称 | 课题来源 | 备注 |
中药马钱子炮制机理的研究 | 国家自然科学基金项目（39070984） | |
50种饮片炮制工艺和质量标准规范化研究 | 科技部十五攻关项目（2001BA701A55） | 首席专家 |
中药饮片煅制共性技术及其相关设备研究 | 科技部“十一五“科技支撑计划课题（2006BAI09B06-04） | 首席专家 |
308味中药饮片标准修订用样品的统一加工炮制研究 | 国家药典委员会课题（YZ-308） | 首席专家 |
创新药物研究开发技术平台建设-中药饮片质量标准研究平台 | 科技部“十二五”重大新药创制科技重大专项（2012ZX09304005-002） | 饮片专项首席专家 |
